Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNC1P63316 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
TNNC1P63316 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms