Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA1P56199 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA1P56199 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms