Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK2P53671 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms