Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCR4P51679 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCR4P51679 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCR4P51679 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCR4P51679 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCR4P51679 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCR4P51679 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCR4P51679 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCR4P51679 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCR4P51679 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCR4P51679 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCR4P51679 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCR4P51679 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCR4P51679 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCR4P51679 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCR4P51679 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCR4P51679 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCR4P51679 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCR4P51679 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCR4P51679 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCR4P51679 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCR4P51679 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCR4P51679 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCR4P51679 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCR4P51679 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCR4P51679 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCR4P51679 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCR4P51679 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCR4P51679 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCR4P51679 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCR4P51679 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCR4P51679 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCR4P51679 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCR4P51679 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCR4P51679 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCR4P51679 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCR4P51679 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCR4P51679 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCR4P51679 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCR4P51679 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCR4P51679 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCR4P51679 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCR4P51679 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCR4P51679 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCR4P51679 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCR4P51679 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCR4P51679 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCR4P51679 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCR4P51679 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCR4P51679 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCR4P51679 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCR4P51679 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCR4P51679 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCR4P51679 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCR4P51679 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCR4P51679 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCR4P51679 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCR4P51679 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCR4P51679 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCR4P51679 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCR4P51679 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCR4P51679 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCR4P51679 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCR4P51679 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCR4P51679 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCR4P51679 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms