Protein–RNA interactions for Protein: P31483

TIA1, Nucleolysin TIA-1 isoform p40, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIA1P31483 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 28.6
TIA1P31483 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SUMO1-208ENST00000409627 722 ntTSL 315.71■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.45e-10■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.025e-10■■■■■ 28.5
TIA1P31483 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.155e-10■■■■■ 28.5
TIA1P31483 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.265e-10■■■■■ 28.5
TIA1P31483 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.365e-10■■■■■ 28.5
TIA1P31483 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.475e-10■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.842e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SRSF11-204ENST00000395136 1408 ntTSL 1 (best)24.36■■□□□ 1.493e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SRSF11-211ENST00000473950 796 ntTSL 522.32■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SRSF11-212ENST00000475204 760 ntTSL 521.23■□□□□ 0.993e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.873e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SRSF11-215ENST00000486667 662 ntTSL 59.85□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 516.47■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.296e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.356e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.721e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.781e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 RSRC2-211ENST00000527173 2570 ntTSL 24.9□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-9■■■■■ 28.5
TIA1P31483 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-9■■■■■ 28.5
TIA1P31483 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.591e-9■■■■■ 28.5
TIA1P31483 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 28.5
TIA1P31483 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 28.5
TIA1P31483 TFRC-205ENST00000426789 354 ntTSL 31.97□□□□□ -2.097e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 GTF2H4-204ENST00000475845 659 ntTSL 218.27■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 28.5
TIA1P31483 GTF2H4-205ENST00000483318 1082 ntTSL 218.27■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 28.5
TIA1P31483 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 28.5
TIA1P31483 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 217.75■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 28.5
TIA1P31483 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 28.5
TIA1P31483 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.184e-8■■■■■ 28.5
TIA1P31483 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 510.15□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 28.4
TIA1P31483 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 28.4
TIA1P31483 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 CALU-201ENST00000249364 3357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 CALU-204ENST00000493278 589 ntTSL 34.87□□□□□ -1.633e-10■■■■■ 28.4
TIA1P31483 HNRNPC-228ENST00000557033 760 ntTSL 38.95□□□□□ -0.989e-9■■■■■ 28.4
TIA1P31483 HNRNPC-215ENST00000555127 929 ntTSL 26.14□□□□□ -1.439e-9■■■■■ 28.4
TIA1P31483 TMED2-204ENST00000543425 1350 ntTSL 312.94□□□□□ -0.349e-11■■■■■ 28.4
TIA1P31483 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.239e-11■■■■■ 28.4
TIA1P31483 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.913e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.633e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 UCHL5-203ENST00000367450 1355 ntTSL 517.78■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 ATG5-209ENST00000636335 1219 ntTSL 514.57□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 SYPL1-201ENST00000011473 2127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 NCAPG-205ENST00000514176 3017 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 ATG5-203ENST00000369070 3088 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 RSRC2-217ENST00000531389 1376 ntTSL 510.2□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 SYPL1-202ENST00000455385 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 RSRC2-203ENST00000392442 928 ntTSL 35.82□□□□□ -1.483e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 RSRC2-206ENST00000525332 516 ntTSL 35.04□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 UCHL5-212ENST00000449480 784 ntTSL 34.64□□□□□ -1.673e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 NCAPG-203ENST00000510063 807 ntTSL 54.11□□□□□ -1.753e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 UCHL5-209ENST00000420791 1329 ntTSL 52.83□□□□□ -1.963e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 ATG5-205ENST00000475645 2659 ntTSL 22.68□□□□□ -1.983e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.053e-8■■■■■ 28.4
TIA1P31483 HNRNPA2B1-205ENST00000476233 1220 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.519e-9■■■■■ 28.4
TIA1P31483 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 28.3
TIA1P31483 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 28.3
TIA1P31483 CYB5A-201ENST00000299438 718 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 28.3
TIA1P31483 CYB5A-207ENST00000583418 5913 ntTSL 28.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 28.3
TIA1P31483 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 28.3
TIA1P31483 CYB5A-206ENST00000580678 1173 ntTSL 1 (best)5.02□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 28.3
TIA1P31483 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 28.3
TIA1P31483 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.593e-10■■■■■ 28.3
TIA1P31483 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.463e-10■■■■■ 28.3
TIA1P31483 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 28.3
TIA1P31483 RELN-204ENST00000429186 891 ntTSL 54.41□□□□□ -1.71e-11■■■■■ 28.3
TIA1P31483 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 28.3
TIA1P31483 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 28.3
TIA1P31483 U2SURP-206ENST00000470400 881 ntTSL 33.83□□□□□ -1.82e-8■■■■■ 28.3
TIA1P31483 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.822e-8■■■■■ 28.3
TIA1P31483 U2SURP-201ENST00000461591 1580 ntTSL 23.52□□□□□ -1.852e-8■■■■■ 28.3
Retrieved 100 of 17,249 protein–RNA pairs in 139.1 ms