Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TSPOP30536 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TSPOP30536 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSPOP30536 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSPOP30536 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSPOP30536 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSPOP30536 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSPOP30536 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSPOP30536 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSPOP30536 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSPOP30536 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSPOP30536 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSPOP30536 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSPOP30536 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSPOP30536 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSPOP30536 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSPOP30536 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms