Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
COL4A5P29400 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL4A5P29400 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL4A5P29400 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL4A5P29400 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL4A5P29400 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL4A5P29400 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms