Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 CPA6-202ENST00000479862 1494 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ATP6V0A1-207ENST00000585828 2139 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ARHGEF40-203ENST00000554514 2928 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IDH3G-205ENST00000444338 597 ntTSL 315.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GFER-203ENST00000565658 1365 ntTSL 1 (best)14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ATP6V0A1-214ENST00000587797 1878 ntTSL 214.83□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IDH3G-211ENST00000497043 851 ntTSL 514.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ARHGEF40-202ENST00000553709 5204 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UBA2-205ENST00000590048 847 ntTSL 314.55□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ARHGEF40-207ENST00000556399 4902 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 JAK1-204ENST00000471473 645 ntTSL 314.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 TALDO1-206ENST00000530666 587 ntTSL 214.1□□□□□ -0.151e-12■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBP1-203ENST00000571175 674 ntTSL 214□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 LAMTOR1-203ENST00000535872 899 ntTSL 513.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBP1-206ENST00000574137 969 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 CPA6-203ENST00000518549 1538 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IDH3G-207ENST00000454076 739 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NDUFS7-217ENST00000591358 3743 nt12.91□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 35.9
RPS3P23396 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 LGALS1-204ENST00000464120 303 ntTSL 212.39□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ATP6V0A1-209ENST00000586201 881 ntTSL 312.31□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBP1-204ENST00000571790 1137 ntTSL 1 (best)12.31□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBP1-201ENST00000283027 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBP1-207ENST00000574334 582 ntTSL 312.02□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 MRPS24-205ENST00000483330 392 ntTSL 211.69□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ARHGEF40-206ENST00000555232 3902 ntTSL 211.68□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ATP6V0A1-219ENST00000588806 842 ntTSL 211.63□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 CPA6-204ENST00000638254 1870 ntTSL 511.61□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 AOC3-203ENST00000588033 542 ntTSL 411.6□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 AOC3-202ENST00000587330 545 ntTSL 511.48□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 PYGL-205ENST00000532462 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBPL-202ENST00000418681 1804 ntTSL 210.61□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 LAMTOR1-204ENST00000538404 1346 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 LAMTOR1-202ENST00000535107 619 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 TALDO1-207ENST00000532202 270 ntTSL 310.11□□□□□ -0.791e-26■■■■■ 35.9
RPS3P23396 AOC3-205ENST00000592999 573 ntTSL 49.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ATP6V0A1-225ENST00000592831 4652 nt9.72□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 LEO1-202ENST00000315141 1981 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 JAK1-202ENST00000465376 814 ntTSL 39.27□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 CPA6-201ENST00000297770 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 PYGL-202ENST00000528757 426 ntTSL 39.1□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 LAMTOR1-207ENST00000544594 849 ntTSL 38.94□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBPL-203ENST00000547839 2001 ntTSL 28.27□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 EIF4A1P4-201ENST00000550578 1213 ntBASIC8.1□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NDUFS2-212ENST00000492153 426 ntTSL 27.66□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBPL-210ENST00000551314 567 ntTSL 47.64□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ATP6V0A1-211ENST00000587299 1000 ntTSL 36.94□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 CCT2-204ENST00000546850 364 ntTSL 24.79□□□□□ -1.644e-8■■■■■ 35.9
RPS3P23396 DDX1-205ENST00000470674 556 ntTSL 24.74□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 CPOX-202ENST00000510489 526 ntTSL 24.18□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 CCT2-206ENST00000548787 852 ntTSL 22.78□□□□□ -1.968e-7■■■■■ 35.9
RPS3P23396 MYL12A-203ENST00000577510 567 ntTSL 21.71□□□□□ -2.142e-10■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBPL-205ENST00000549838 556 ntTSL 51.69□□□□□ -2.141e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UBA2-207ENST00000592672 353 ntTSL 30.55□□□□□ -2.321e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ERO1A-206ENST00000556039 1855 ntTSL 530.22■■■□□ 2.433e-8■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ERO1A-203ENST00000554019 2094 ntTSL 527.47■■□□□ 1.993e-8■■■■■ 35.9
RPS3P23396 PRDX4-205ENST00000495599 632 ntTSL 316.43■□□□□ 0.222e-13■■■■■ 35.9
RPS3P23396 PRDX4-203ENST00000379349 815 ntTSL 311.53□□□□□ -0.562e-13■■■■■ 35.9
RPS3P23396 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-13■■■■■ 35.9
RPS3P23396 COMT-211ENST00000493893 354 ntTSL 313.33□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 35.8
RPS3P23396 C1QBP-205ENST00000573421 330 ntTSL 21.79□□□□□ -2.123e-10■■■■■ 35.8
RPS3P23396 HSPD1-206ENST00000430176 754 ntTSL 55.14□□□□□ -1.595e-28■■■■■ 35.8
RPS3P23396 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 35.8
RPS3P23396 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 35.8
RPS3P23396 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 35.8
RPS3P23396 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 35.8
RPS3P23396 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 35.8
RPS3P23396 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 35.8
RPS3P23396 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 35.8
RPS3P23396 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 35.8
RPS3P23396 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 35.8
RPS3P23396 MAGED2-202ENST00000347546 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 35.8
RPS3P23396 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.393e-10■■■■■ 35.7
RPS3P23396 MYDGF-204ENST00000599761 463 ntTSL 311.55□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 35.7
RPS3P23396 RRM1-204ENST00000526865 562 ntTSL 44.14□□□□□ -1.752e-6■■■■■ 35.7
RPS3P23396 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-11■■■■■ 35.6
RPS3P23396 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.152e-11■■■■■ 35.6
RPS3P23396 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.212e-11■■■■■ 35.6
RPS3P23396 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.282e-11■■■■■ 35.6
RPS3P23396 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)6.25□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 35.6
RPS3P23396 APOE-202ENST00000425718 923 ntTSL 1 (best)23.79■■□□□ 1.45e-53■■■■■ 35.6
RPS3P23396 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 221.59■■□□□ 1.055e-53■■■■■ 35.6
RPS3P23396 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-9■■■■■ 35.5
Retrieved 100 of 24,271 protein–RNA pairs in 209.8 ms