Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBG1P23258 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBG1P23258 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms