Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCP2P22307 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCP2P22307 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCP2P22307 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCP2P22307 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCP2P22307 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCP2P22307 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCP2P22307 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCP2P22307 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCP2P22307 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCP2P22307 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCP2P22307 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCP2P22307 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCP2P22307 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCP2P22307 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCP2P22307 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCP2P22307 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCP2P22307 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCP2P22307 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCP2P22307 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCP2P22307 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCP2P22307 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCP2P22307 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCP2P22307 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCP2P22307 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCP2P22307 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCP2P22307 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCP2P22307 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCP2P22307 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCP2P22307 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCP2P22307 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCP2P22307 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCP2P22307 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCP2P22307 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCP2P22307 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCP2P22307 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCP2P22307 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCP2P22307 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCP2P22307 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCP2P22307 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCP2P22307 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCP2P22307 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCP2P22307 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCP2P22307 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCP2P22307 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCP2P22307 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCP2P22307 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCP2P22307 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCP2P22307 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCP2P22307 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCP2P22307 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCP2P22307 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCP2P22307 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCP2P22307 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCP2P22307 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCP2P22307 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCP2P22307 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCP2P22307 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCP2P22307 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCP2P22307 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCP2P22307 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCP2P22307 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCP2P22307 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCP2P22307 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCP2P22307 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCP2P22307 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCP2P22307 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCP2P22307 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCP2P22307 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCP2P22307 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms