Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DSPP15924 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSPP15924 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSPP15924 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSPP15924 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSPP15924 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSPP15924 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSPP15924 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSPP15924 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSPP15924 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSPP15924 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSPP15924 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DSPP15924 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSPP15924 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSPP15924 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSPP15924 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSPP15924 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSPP15924 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DSPP15924 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSPP15924 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSPP15924 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSPP15924 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSPP15924 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DSPP15924 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSPP15924 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DSPP15924 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DSPP15924 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSPP15924 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSPP15924 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DSPP15924 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSPP15924 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSPP15924 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSPP15924 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSPP15924 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSPP15924 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSPP15924 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSPP15924 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms