Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-30-5P0DP03 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms