Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UBBP0CG47 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBBP0CG47 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBBP0CG47 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms