Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA4P06727 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA4P06727 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA4P06727 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA4P06727 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA4P06727 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA4P06727 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOA4P06727 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOA4P06727 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA4P06727 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA4P06727 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOA4P06727 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA4P06727 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA4P06727 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA4P06727 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA4P06727 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA4P06727 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA4P06727 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA4P06727 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOA4P06727 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA4P06727 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA4P06727 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA4P06727 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA4P06727 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA4P06727 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA4P06727 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA4P06727 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA4P06727 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA4P06727 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA4P06727 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA4P06727 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA4P06727 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA4P06727 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA4P06727 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA4P06727 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA4P06727 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA4P06727 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA4P06727 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA4P06727 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
APOA4P06727 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA4P06727 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA4P06727 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA4P06727 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms