Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAMBPO95630 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STAMBPO95630 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPO95630 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms