Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCELO95171 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCELO95171 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCELO95171 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCELO95171 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCELO95171 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCELO95171 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCELO95171 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCELO95171 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCELO95171 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCELO95171 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCELO95171 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCELO95171 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCELO95171 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCELO95171 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCELO95171 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCELO95171 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCELO95171 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCELO95171 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCELO95171 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCELO95171 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCELO95171 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCELO95171 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCELO95171 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCELO95171 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCELO95171 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCELO95171 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCELO95171 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCELO95171 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCELO95171 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCELO95171 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCELO95171 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCELO95171 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCELO95171 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCELO95171 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCELO95171 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCELO95171 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCELO95171 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCELO95171 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCELO95171 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCELO95171 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCELO95171 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCELO95171 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCELO95171 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCELO95171 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCELO95171 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCELO95171 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCELO95171 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCELO95171 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCELO95171 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCELO95171 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCELO95171 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCELO95171 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCELO95171 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCELO95171 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCELO95171 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCELO95171 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCELO95171 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCELO95171 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCELO95171 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCELO95171 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms