Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOBOXO60393 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOBOXO60393 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NOBOXO60393 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms