Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF1CO43896 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms