Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM1O43490 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROM1O43490 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROM1O43490 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM1O43490 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM1O43490 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM1O43490 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM1O43490 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM1O43490 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM1O43490 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM1O43490 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM1O43490 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM1O43490 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM1O43490 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM1O43490 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM1O43490 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM1O43490 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM1O43490 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM1O43490 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM1O43490 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM1O43490 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM1O43490 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM1O43490 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM1O43490 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM1O43490 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM1O43490 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM1O43490 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM1O43490 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM1O43490 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM1O43490 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM1O43490 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM1O43490 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM1O43490 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM1O43490 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM1O43490 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROM1O43490 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROM1O43490 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROM1O43490 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROM1O43490 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROM1O43490 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROM1O43490 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROM1O43490 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PROM1O43490 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROM1O43490 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROM1O43490 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROM1O43490 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROM1O43490 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROM1O43490 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PROM1O43490 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PROM1O43490 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PROM1O43490 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PROM1O43490 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROM1O43490 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROM1O43490 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PROM1O43490 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PROM1O43490 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PROM1O43490 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROM1O43490 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROM1O43490 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROM1O43490 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PROM1O43490 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms