Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF4O43474 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF4O43474 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF4O43474 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF4O43474 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF4O43474 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF4O43474 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF4O43474 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF4O43474 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF4O43474 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF4O43474 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF4O43474 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF4O43474 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF4O43474 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF4O43474 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF4O43474 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF4O43474 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF4O43474 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF4O43474 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF4O43474 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF4O43474 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF4O43474 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF4O43474 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF4O43474 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms