Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR1CO15160 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR1CO15160 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms