Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNPHO15079 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNPHO15079 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNPHO15079 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNPHO15079 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNPHO15079 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNPHO15079 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNPHO15079 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNPHO15079 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNPHO15079 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNPHO15079 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNPHO15079 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNPHO15079 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNPHO15079 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNPHO15079 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNPHO15079 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNPHO15079 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNPHO15079 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNPHO15079 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNPHO15079 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNPHO15079 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNPHO15079 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNPHO15079 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNPHO15079 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNPHO15079 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNPHO15079 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNPHO15079 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNPHO15079 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNPHO15079 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNPHO15079 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNPHO15079 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNPHO15079 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNPHO15079 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNPHO15079 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNPHO15079 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNPHO15079 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNPHO15079 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNPHO15079 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNPHO15079 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNPHO15079 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNPHO15079 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNPHO15079 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNPHO15079 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNPHO15079 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNPHO15079 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNPHO15079 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNPHO15079 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNPHO15079 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNPHO15079 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNPHO15079 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNPHO15079 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNPHO15079 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNPHO15079 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNPHO15079 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNPHO15079 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms