Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2LO15068 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms