Protein–RNA interactions for Protein: O14939

PLD2, Phospholipase D2, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD2O14939 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLD2O14939 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLD2O14939 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLD2O14939 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLD2O14939 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLD2O14939 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLD2O14939 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLD2O14939 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLD2O14939 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLD2O14939 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLD2O14939 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLD2O14939 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLD2O14939 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLD2O14939 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLD2O14939 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLD2O14939 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLD2O14939 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLD2O14939 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLD2O14939 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLD2O14939 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLD2O14939 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLD2O14939 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLD2O14939 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLD2O14939 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLD2O14939 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLD2O14939 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLD2O14939 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLD2O14939 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLD2O14939 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLD2O14939 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLD2O14939 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLD2O14939 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLD2O14939 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLD2O14939 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLD2O14939 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLD2O14939 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD2O14939 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD2O14939 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD2O14939 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD2O14939 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD2O14939 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD2O14939 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD2O14939 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLD2O14939 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD2O14939 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD2O14939 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD2O14939 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD2O14939 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD2O14939 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD2O14939 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLD2O14939 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD2O14939 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD2O14939 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD2O14939 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD2O14939 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD2O14939 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD2O14939 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD2O14939 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLD2O14939 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLD2O14939 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLD2O14939 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLD2O14939 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLD2O14939 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLD2O14939 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD2O14939 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD2O14939 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD2O14939 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD2O14939 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD2O14939 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD2O14939 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLD2O14939 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD2O14939 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD2O14939 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD2O14939 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD2O14939 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLD2O14939 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLD2O14939 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLD2O14939 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms