Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BCKDKO14874 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms