Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAFD1O14545 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAFD1O14545 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAFD1O14545 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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