Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
F8VP50 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
F8VP50 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
F8VP50 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
F8VP50 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
F8VP50 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
F8VP50 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
F8VP50 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
F8VP50 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8VP50 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8VP50 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8VP50 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8VP50 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8VP50 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8VP50 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
F8VP50 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8VP50 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8VP50 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
F8VP50 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8VP50 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8VP50 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8VP50 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8VP50 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8VP50 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8VP50 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
F8VP50 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
F8VP50 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
F8VP50 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F8VP50 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
F8VP50 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F8VP50 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F8VP50 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F8VP50 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F8VP50 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F8VP50 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8VP50 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
F8VP50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
F8VP50 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F8VP50 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F8VP50 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F8VP50 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F8VP50 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8VP50 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8VP50 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
F8VP50 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8VP50 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8VP50 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8VP50 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8VP50 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8VP50 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8VP50 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F8VP50 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F8VP50 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F8VP50 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F8VP50 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F8VP50 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
F8VP50 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8VP50 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8VP50 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8VP50 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms