Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF839A8K0R7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF839A8K0R7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms