Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf60A6NFR6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms