Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPN1LA6NDY0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPN1LA6NDY0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPN1LA6NDY0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms