Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC26A0AVF1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC26A0AVF1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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