Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms