Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SPTSSAQ969W0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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