Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms