Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPFIBP2Q8ND30 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPFIBP2Q8ND30 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms