Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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