Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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