Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
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PTPRKQ15262 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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PTPRKQ15262 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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PTPRKQ15262 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRKQ15262 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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