Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2V1Q13404 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms