Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.091e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.861e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.821e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.755e-20■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SEPT5-215ENST00000490204 774 ntTSL 524.44■■□□□ 1.51e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.431e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.325e-20■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 BAG6-257ENST00000462875 972 ntTSL 222.14■■□□□ 1.131e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.121e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.111e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.655e-20■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ATP5J-208ENST00000486002 876 ntTSL 218.49■□□□□ 0.558e-24■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SEPT5-208ENST00000431124 920 ntTSL 518.47■□□□□ 0.551e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CCNG1-204ENST00000506186 580 ntTSL 218.31■□□□□ 0.521e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PDCD5-201ENST00000221784 558 ntTSL 316.83■□□□□ 0.285e-20■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.285e-20■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.285e-20■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RPP30-209ENST00000487998 1466 ntTSL 515.26■□□□□ 0.031e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TCF25-210ENST00000563484 468 ntTSL 213.65□□□□□ -0.221e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SRPRB-203ENST00000481356 1487 ntTSL 213.22□□□□□ -0.291e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RPP30-204ENST00000414836 726 ntTSL 311.01□□□□□ -0.651e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RPP30-207ENST00000479678 527 ntTSL 211.01□□□□□ -0.651e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SRPRB-202ENST00000466636 917 ntTSL 310.69□□□□□ -0.71e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RPP30-210ENST00000489806 1315 ntTSL 58.77□□□□□ -1.011e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RPP30-205ENST00000466462 643 ntTSL 38.7□□□□□ -1.021e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.111e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RPP30-208ENST00000480406 701 ntTSL 57.19□□□□□ -1.261e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RPP30-206ENST00000470933 624 ntTSL 56.97□□□□□ -1.291e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ITGB1-214ENST00000488427 861 ntTSL 1 (best)6.25□□□□□ -1.411e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.571e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PDCD5-205ENST00000586316 480 ntTSL 24.95□□□□□ -1.625e-20■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TUG1-208ENST00000602393 2233 ntTSL 24.01□□□□□ -1.773e-16■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.813e-16■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TUG1-203ENST00000540687 2744 ntTSL 1 (best)3.5□□□□□ -1.853e-16■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.055e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.395e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 RBX1-202ENST00000467617 1871 ntTSL 216.31■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 ACP1-206ENST00000413140 689 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 ACP1-210ENST00000463831 1015 ntTSL 213.17□□□□□ -0.32e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.482e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 02e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SEC13-216ENST00000479868 2374 ntTSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.12e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SEC13-219ENST00000492602 393 ntTSL 36.92□□□□□ -1.32e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.874e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.994e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 AARS-207ENST00000569825 871 ntTSL 220.13■□□□□ 0.814e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 PSMC5-208ENST00000580265 646 ntTSL 419.42■□□□□ 0.74e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 PAFAH1B2-203ENST00000526888 1099 ntTSL 218.63■□□□□ 0.574e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.564e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.414e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 PPT1-208ENST00000529905 1836 ntTSL 517■□□□□ 0.314e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.244e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 RGS10-203ENST00000392865 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SH3BGRL-202ENST00000463546 755 ntTSL 210.6□□□□□ -0.714e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SH3BGRL-204ENST00000481106 928 ntTSL 1 (best)10.03□□□□□ -0.84e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SH3BGRL-203ENST00000474113 739 ntTSL 39.99□□□□□ -0.814e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.144e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.394e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.434e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 RGS10-204ENST00000469575 316 ntTSL 34.16□□□□□ -1.744e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 PTP4A2-213ENST00000532001 911 ntTSL 510.51□□□□□ -0.733e-33■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.098e-15■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 FAM136A-204ENST00000450256 936 ntTSL 225.18■■□□□ 1.628e-15■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.588e-15■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 FAM136A-205ENST00000460307 2398 ntTSL 1 (best)21.73■■□□□ 1.078e-15■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.288e-15■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.288e-15■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-12■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.41e-12■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 STRAP-206ENST00000541731 1698 ntTSL 211.4□□□□□ -0.583e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 STRAP-204ENST00000538718 648 ntTSL 36.84□□□□□ -1.313e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 STRAP-205ENST00000539887 676 ntTSL 25.23□□□□□ -1.573e-9■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SEC11A-210ENST00000560409 819 ntTSL 37.85□□□□□ -1.151e-8■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 TMEM189-205ENST00000453505 2028 ntTSL 1 (best)22.18■■□□□ 1.145e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.075e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.514e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SCAMP2-203ENST00000563663 1787 ntTSL 517.33■□□□□ 0.365e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.345e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.295e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 WDR13-207ENST00000482760 562 ntTSL 316.58■□□□□ 0.245e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-205ENST00000413202 422 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.245e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.235e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.215e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SCAMP2-211ENST00000569251 867 ntTSL 215.66■□□□□ 0.15e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.085e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 515.25■□□□□ 0.031e-20■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.034e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.055e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.095e-11■□□□□ 8.8
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 398.2 ms