Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms