Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms