Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RHDQ02161 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHDQ02161 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHDQ02161 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHDQ02161 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHDQ02161 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RHDQ02161 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHDQ02161 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms