Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN12P56749 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CLDN12P56749 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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CLDN12P56749 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN12P56749 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN12P56749 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN12P56749 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CLDN12P56749 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN12P56749 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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