Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDF10P55107 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDF10P55107 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDF10P55107 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GDF10P55107 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GDF10P55107 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms