Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

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Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RORCP51449 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RORCP51449 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RORCP51449 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RORCP51449 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RORCP51449 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RORCP51449 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RORCP51449 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RORCP51449 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RORCP51449 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RORCP51449 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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