Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
IL3RAP26951 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms