Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NFKBIAP25963 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms