Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSLP07711 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms