Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDR42E2A6NKP2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms